Yakuza 0 Hikayesi
Üvey babası Shintaro Kazama'yı cezadan korumak için Kiryu, Tojo klanından ayrılır. Kiryu, Dojima'dan önce Empty Lot'u almasına yardım etmesi karşılığında adını temize çıkarmayı vaat eden emlakçı Tetsu Tachibana ile tanışır. Kiryu kabul eder.
Tachibana'nın sağ kolu olan Kiryu ve Jun Oda, Dojima ailesiyle ilgili gecekondulara müdahale ettikten sonra, Dojima teğmenleri Kiryu'nun Tachibana'yı teslim etmesini talep eder. Kiryu reddeder ve Dojima ailesini onu avlamaya sevk eder. Yeminli kardeşi Akira Nishikiyama, birbirlerini güvende tutmak için Kiryu ile bağlarını keser. Tachibana, Kiryu'ya Empty Lot'un sahibinin, Sotenbori, Osaka'da yaşayan ve psikojenik körlükten muzdarip olan yabancı kız kardeşi Makoto olduğunu söyler.
Sotenbori'de eski yakuza Goro Majima, Tojo Klanının rakipleri olan Omi Alliance'ın bir üyesi olan Tsukasa Sagawa tarafından bir kabare kulübü işletmek zorunda kalır. Tojo klanının gizli bir haini olan Futoshi Shimano'nun emirlerini takiben Sagawa, Majima'ya Makoto'ya suikast düzenleyerek Shimano Ailesine yeniden katılma şansı sunar. Majima, Makoto'yu eski bir suikastçı olan Wen Hai Lee'nin koruması altında bulur.
Majima, Makoto'yu korumaya karar verdikten sonra, Lee, Sagawa'yı kandırmak için Makoto'ya benzeyen birini öldürmeyi önerir. Shibusawa'nın asistanı Homare Nishitani bunu yapar. Dolandırıcılıktan şüphelenen Sagawa, Lee'yi öldürür. Sagawa daha sonra Majima ve Makoto'yu öldürmeye çalışır, ancak Kazama'nın müttefiki Masaru Sera tarafından durdurulur ve Makoto'yu götürür. Majima ve Sagawa, Sera ile yüzleşir ve Makoto'yu Kamurocho'daki Kiryu'ya teslim ettiğini öğrenir.
Kiryu ve Oda, Sera ile tanışırlar ve Sera onlara Makoto'nun Empty Lot'u istemeyerek dedesinden miras aldığını söyler. Makoto'ya Kamurocho'ya kadar eşlik ederler ama Shibusawa'nın adamları tarafından kovalanırlar. Shibusawa için bir köstebek olduğu ortaya çıkan Oda, Kiryu ve Makoto'yu öldürmeye çalışır. Kiryu ona boyun eğdirir ve Oda, kendisinin ve Tachibana'nın Japonya'daki eski Çinli gangsterler olduğunu açıklar.
O sırada Makoto, erkek kardeşini bulmak için Japonya'ya göç etti, ancak onu Koreli bir çeteye satan Oda'yla ters düşer ve burada cinsel istismara uğrar. Oda, Makoto'nun kimliğini Tachibana'nın onu bir belgeselde gördükten sonra keşfeder ve o zamandan beri onun misillemesinden korkar. Suçlarından pişman olarak, Shibusawa tarafından idam edilmeden önce Kiryu ve Makoto'nun kaçmasına izin verir.
Kiryu, Makoto'nun onu aradığını bildiğini açıklayan Tachibana ile tanışır. Ayrıca, Empty Lot'un mirasını öğrendikten sonra, Makoto'yu Kazama ailesini de yok etmeyi planlayan Dojima'dan korumak için şirketini kurmasına yardım eden Kazama'ya döndüğünü ortaya koyuyor. Çıkarları çakışan Kiryu ve Tachibana kaçar ama Tachibana, Dojima'nın suikastçısı Lao Gui, Boş Lot cinayetinin faili tarafından yakalanır. Tachibana, Kiryu ve Nishikiyama'nın yendiği Kuze ve adamları tarafından işkence edilerek öldürülür. Makoto, erkek kardeşinin cesedini keşfeder ve görüşünü geri kazanır.
Majima, Shimano'nun aslında Majima'nın Makoto'yu korumayı amaçladığını ve böylece Empty Lot'un Omi Alliance'a isteyerek satacağını öğrenir. Majima, Makoto'yu Empty Lot'ta bulur ve Tachibana'nın ölümü için intikam planları yapar. Majima'nın endişelerine rağmen, Makoto Dojima ile tanışır ve teğmenlerinin ölümü karşılığında Empty Lot'u teklif eder. Dojima reddeder ve Lao Gui'ye onu vurmasını emreder. Sera gelir ve Makoto'yu hastaneye götürür. Ancak, Shibusawa Makoto'yu bulur ve onu bir gemide esir tutar. Kiryu ve ailesi gemiye saldırıp Makoto'yu kurtarırken, Majima Dojima ailesini Tojo Karargahında yenerek Awano'nun ölümüyle sonuçlanır.
Sera sonunda Empty Lot'y alır. Majima'ya ihanetinden dolayı Shimano'yu öldürmesini emreder, ancak Shimano, Omi Alliance ile olan anlaşmalarını sona erdirir ve Majima'yı ailesine geri verir. Bu Sagawa'nın suikastiyle sonuçlanır. 1989'da Sera, Tojo klanının Başkanı olur ve Dojima teğmenlerini kaybettikten sonra can çekişir. Empty Lot yıkılır ve yerine Milenyum Kulesi inşa edilir. Bu arada Majima, macerasından ilham alarak daha tehlikeli bir şekilde yaşamaya karar verir. Makoto'nun yeni erkek arkadaşıyla huzurlu bir hayat sürmesine izin verir ve Kiryu ile Kamurocho'da neşeyle tanışır.